רב בית הספר שנבחר לתפקידו על פי הקרטריונים של החינוך הדתי משרד החינוך, הנו בעל הסמכות ההלכתית בכל הנוגע לשאלות הלכתיות הנוגעות לבית הספר. כמובן שחשוב שיהיה בקשר עם הרב המקומי בענינים אלה. פסקי רב בית הספר מחייבים את המורים והתלמידים בתוך כותלי בית הספר. מאידך, אין חיוב על המורה או התלמיד לנהוג כן בביתו אם הוריו סומכים על רב אחר.